微生物の全ゲノムシーケンス解析

　微生物を対象とした全ゲノム解析サービスの提供を開始しました。細菌のスクリーニング後の遺伝子解析や比較ゲノム解析、パンゲノム解析をはじめとした様々な研究にお役立てください。
【サービスの特徴】
  • データ解析（ゲノムアセンブリ、遺伝子アノテーション）を含めた、サンプル調製からの作業工程を一貫してお引き受けいたします。ご依頼サンプルをお送りただくだけで、高品質のゲノム解析結果を得ることができます。
  • DNA抽出サービスもご用意しております。様々なサンプル形態でのご依頼が可能です。
  • ご希望の解析内容に沿ったプランでの解析も可能です。

【解析内容】
　ゲノムDNAからライブラリー調製を実施し、微生物の全ゲノムを対象に塩基配列の解読を行います。解読した高品質の塩基配列データを基に、信頼性の高い細菌のドラフトゲノム配列を構築します。
​　決定したゲノム配列について遺伝子のアノテーション付加を行い、保有している遺伝子情報を取得します。

【価格】
　115,000円／サンプル（税別）

【納期】1.5か月
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【納品物】解析報告書、塩基配列データ、ドラフトゲノム配列、アセンブリの統計情報、
​                  アノテーションデータ (予測遺伝子の塩基配列・アミノ酸配列)

プロモーター解析（オプション）

　プロモーター解析では、ゲノム塩基配列から遺伝子の発現を制御するDNA領域の予測を行います。制御領域に結合する転写制御因子の予測も可能で、遺伝子機能の推定に役立ちます。一歩進んだオミックス解析のツールとしてご活用ください。
　既に配列決定済みのシーケンスデータからの解析も承っております。ご希望の条件に合わせた解析にも対応致しますので、お気軽にお問い合わせください。​
​予測したプロモーター領域をIGV (ゲノムブラウザー) により可視化した結果、遺伝子上流にあるプロモーター領域が描写されています。

代謝パスウェイ解析（オプション）

　代謝パスウェイ解析では、ゲノム配列に含まれる遺伝子情報をパスウェイデータベースに割り当てることで、その微生物が保有する代謝パスウェイを推定します。個々の遺伝子情報を代謝ネットワーク情報と紐づけることで、微生物がもつ生理機能を体系的に捉えることが可能になります。代謝パスウェイの可視化や代謝機能の比較解析、微生物の培養条件検討をはじめとした様々な研究にお役立てください。
　既に配列決定済みのシーケンスデータからの解析も承っております。ご希望の条件に合わせた解析にもご対応致しますので、お気軽にお問い合わせください。
２つの生物種で代謝機能を比較した結果。各菌が保有する代謝機能がそれぞれ緑・ピンク色で示されています。