各種統計解析

　ご要望に応じて、いただいたサンプルの各種統計解析を致します。
  • 多様性解析（α多様性解析・β多様性解析）
  • 多変量解析（主成分分析、主座標分析、回帰分析など）
  • 有意差検定、群間比較（クラスカル・ウォリス検定、ウィルコクソンの順位和検定、LefSE）
 
その他の解析も承っております。ご相談ください。
​例）サンプル間類似性を可視化
​例）多様性解析
【α多様性】検体内の細菌種の多様性
  • 種の豊富さ 　　　Observed otus
  • 種の多様性 　　　Shannon & Simpson：多様度指数
　　　　　　　　　　　PD whole tree：分子系統樹に基づく多様度指数
【β多様性】検体間の細菌叢組成の違い
  • 類似度
​例）多群間比較・有意差検定
菌種（群）毎にサンプル間の有意差を検定します。
​例）次元削減とクラスタリング

​細菌叢データのような多次元データを類似度で２次元平面上に可視化する解析。
この例では、細菌叢が４つのグループに分かれることが見出された。それぞれのグループでは特徴となる多数派の細菌種が異なることが、下流解析から分かった。